Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf3P61205 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf3P61205 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms