Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3b6P59708 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b6P59708 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b6P59708 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms