Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup43P59235 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nup43P59235 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nup43P59235 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nup43P59235 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms