Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdrg1P59048 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdrg1P59048 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdrg1P59048 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdrg1P59048 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms