Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Paxbp1P58501 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paxbp1P58501 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms