Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rce1P57791 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rce1P57791 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rce1P57791 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rce1P57791 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms