Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp25P57080 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp25P57080 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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