Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rrp1P56183 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1P56183 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms