Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dsc2P55292 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dsc2P55292 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms