Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcd3P55096 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms