Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms