Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fdft1P53798 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fdft1P53798 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fdft1P53798 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms