Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Map3k1P53349 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Map3k1P53349 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Map3k1P53349 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms