Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2e1P52482 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e1P52482 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e1P52482 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms