Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ClgnP52194 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClgnP52194 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ClgnP52194 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ClgnP52194 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms