Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApodP51910 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApodP51910 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApodP51910 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApodP51910 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApodP51910 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApodP51910 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApodP51910 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms