Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr4P51680 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccr4P51680 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms