Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XpcP51612 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XpcP51612 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XpcP51612 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XpcP51612 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XpcP51612 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XpcP51612 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XpcP51612 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XpcP51612 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XpcP51612 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XpcP51612 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XpcP51612 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XpcP51612 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XpcP51612 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XpcP51612 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XpcP51612 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XpcP51612 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XpcP51612 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XpcP51612 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XpcP51612 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XpcP51612 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XpcP51612 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XpcP51612 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XpcP51612 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XpcP51612 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XpcP51612 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XpcP51612 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XpcP51612 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XpcP51612 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XpcP51612 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XpcP51612 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XpcP51612 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XpcP51612 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XpcP51612 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
XpcP51612 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XpcP51612 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms