Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa8P50706 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms