Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FmodP50608 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FmodP50608 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FmodP50608 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FmodP50608 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FmodP50608 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FmodP50608 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms