Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpdP50404 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SftpdP50404 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SftpdP50404 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SftpdP50404 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SftpdP50404 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms