Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BckdhaP50136 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BckdhaP50136 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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