Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HpdP49429 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HpdP49429 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HpdP49429 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HpdP49429 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HpdP49429 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HpdP49429 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HpdP49429 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HpdP49429 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HpdP49429 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HpdP49429 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HpdP49429 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HpdP49429 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HpdP49429 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HpdP49429 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HpdP49429 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HpdP49429 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HpdP49429 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HpdP49429 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HpdP49429 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HpdP49429 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HpdP49429 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HpdP49429 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HpdP49429 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HpdP49429 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HpdP49429 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HpdP49429 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HpdP49429 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HpdP49429 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HpdP49429 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HpdP49429 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HpdP49429 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HpdP49429 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HpdP49429 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HpdP49429 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HpdP49429 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HpdP49429 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HpdP49429 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HpdP49429 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms