Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prox1P48437 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms