Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rfx2P48379 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rfx2P48379 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms