Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rplp1P47955 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rplp1P47955 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms