Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sipa1P46062 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sipa1P46062 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sipa1P46062 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms