Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h1bP43276 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist1h1bP43276 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hist1h1bP43276 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms