Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkx1-2P42580 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx1-2P42580 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx1-2P42580 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms