Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ThpoP40226 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ThpoP40226 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ThpoP40226 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms