Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf2P39429 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf2P39429 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms