Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf1P39428 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Traf1P39428 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf1P39428 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf1P39428 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms