Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtlP38585 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TtlP38585 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtlP38585 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtlP38585 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtlP38585 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtlP38585 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtlP38585 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtlP38585 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtlP38585 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtlP38585 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TtlP38585 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TtlP38585 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtlP38585 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TtlP38585 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms