Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lig1P37913 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig1P37913 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms