Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PpargP37238 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpargP37238 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpargP37238 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpargP37238 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpargP37238 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpargP37238 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpargP37238 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpargP37238 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PpargP37238 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PpargP37238 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PpargP37238 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms