Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc5P35689 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ercc5P35689 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms