Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddit3P35639 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddit3P35639 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms