Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab20P35295 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab20P35295 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab20P35295 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab20P35295 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab20P35295 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab20P35295 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab20P35295 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms