Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stfa1P35175 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stfa1P35175 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms