Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cbx2P30658 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx2P30658 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms