Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VtnP29788 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VtnP29788 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VtnP29788 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VtnP29788 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VtnP29788 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VtnP29788 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VtnP29788 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VtnP29788 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms