Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RxraP28700 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RxraP28700 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RxraP28700 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RxraP28700 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RxraP28700 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RxraP28700 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RxraP28700 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RxraP28700 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RxraP28700 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RxraP28700 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RxraP28700 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RxraP28700 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RxraP28700 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RxraP28700 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RxraP28700 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RxraP28700 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RxraP28700 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RxraP28700 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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