Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc6a9P28571 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms