Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd9P28357 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms