Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms