Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-DMaP28078 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-DMaP28078 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-DMaP28078 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms