Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vav1P27870 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vav1P27870 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vav1P27870 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms