Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpbP27790 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CenpbP27790 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CenpbP27790 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms