Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af2P26369 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af2P26369 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af2P26369 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af2P26369 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af2P26369 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms