Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabra3P26049 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra3P26049 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra3P26049 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms